Comme nous l'avons déjà précisé mapserver n'est pas disponible dans l'arborescence officielle de gentoo c'est pourquoi il nous faut télécharger son ebuild. Pour ce faire deux solutions, la première consiste à se rendre sur cette page est d'y télécharger la dernière version de l'ebuild de mapserver (mapserver-4.6.1.ebuild), la seconde consiste en l'utilisation de la commande suivante :
wget -O mapserver-4.6.1.ebuild "http://bugs.gentoo.org/attachment.cgi?id=70931".
Une fois que vous avez votre copie de mapserver-4.6.1.ebuild, il vous faut créer un répertoire permettant de stocker cet ebuild : sci-geosciences/mapserver. Maintenant vous devez copier le fichier mapserver-4.6.1.ebuild dans ce répertoire puis utiliser la commande :
ebuild /usr/local/portage/sci-geoscience/mapserver/mapserver-4.6.1.ebuild digest afin de télécharger les sources du paquet et de stocker les md5 pour une futur utilisation 
.
Si vous souhaitiez utiliser un autre ebuild qui ne soit pas déjà dans portage, il vous faudra procéder de façon similaire.